随后,马来西亚官方强烈谴责姜哲的“无理指控”。2月28日,以前朝鲜驻联合国副代表李东日为首的朝鲜代表团来到马来西亚,与马来西亚外交部商谈关于金正男死亡事件的解决方式,与两国的外交关系。在会议上,马方提出,要求朝鲜政府针对朝鲜大使最近对马来西亚的指控作出书面道歉。马方表明,如果马来西亚政府在当日晚间10时没有收到任何答复,那马来西亚政府将采取最能够保护国家利益的措施。但当晚朝鲜方面没有任何回应。
3月2日,马来西亚取消了对朝鲜公民免签证政策。
3月3日,金正男被谋杀案的嫌疑人李忠哲因为证据不足,被无罪释放;且因他签证过期,于是在马来西亚警方和移民局合作下,李忠哲随即被遣返回国。飞机从吉隆坡第一国际机场,首先飞到北京,然后从北京再飞往朝鲜。在北京时,李忠哲在朝鲜驻北京大使馆面对媒体,声泪俱下,他说他在吉隆坡遭受了极其不公正的对待,马来西亚当局以其家属性命作要挟,称已经逮捕他的家属,如果李忠哲认罪,就可以与他的家属继续居住在马来西亚,而如果拒绝认罪,则家属安全难保。
3月4日,马来西亚外交部对朝鲜驻马大使姜哲发出了驱逐令。在马来西亚外交部给朝鲜大使馆的信函中也提到“马来西亚將对任何侮辱、或企图损害我国声誉的行为,采取强硬对策。”