朱檀死后,其唯一的子嗣即次妃戈氏之子朱肇煇刚出生不到两年,因朱元璋对朱檀的厌恶,也导致朱肇煇迟迟没有继承鲁王爵位而一直以世子的身份生活,直到明成祖即位才将其封为鲁王。朱肇煇虽然不是朱檀正王妃汤氏的亲生儿子,但由于其与朱檀没有孩子,所以汤氏对朱肇煇疼爱有加并教其礼乐诗书,而朱棣也十分喜爱这个小侄子,每次经过兖州时都会去看望朱肇煇。朱肇煇成为鲁王后礼贤下士,明宣宗朱瞻基即位后朱肇煇曾上书宣宗请求宣宗允许做事勤勉的国长史郑昭等人退休并得到宣宗认可。1466年,历经洪武、建文、永乐、洪熙、宣德、正统、景泰、天顺、成化九朝八帝的二代鲁王朱肇煇去世,是为鲁靖王,享年79岁,而他也是明朝藩王中最长寿的。
鲁靖王去世之后鲁王又历经数代传承,但大多平庸无奇,时光流传至明末,1640年朱以派袭封鲁王爵位,成为第十位鲁王,他也是有明一代的倒数第二位鲁王。但此时的明王朝已经是内外交困,李自成率领的农民军在国内势如破竹般的攻破一座座城池,关外女真一族依靠八旗铁骑和从汉人手里学到的火炮技术驰骋于山海关内外的疆土。1642年清军再次攻入关内并突袭山东兖州府,尽管知府邓藩锡拼死抵抗,但由于奸细出卖导致城门被打开,知府等明朝官员被清军抓住后残忍杀害,而鲁王朱以派也率领一家老少在王府内自缢身亡。