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[好摄之徒] 人类是“病毒的孩子”??

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发表于 2021-6-16 02:19 PM | 显示全部楼层 |阅读模式


人类是“病毒的孩子”??

 国家地理 国家地理中文网  2021-06-16



人类是”病毒的孩子“??

这难道不是极大的谬论吗?

今天我们就来大胆地、

以全新视角看看这个问题吧。


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摄影:LENNART NILSSON, TT/SCIENCE PHOTO LIBRARY (COMPOSITE OF TWO IMAGES)


新冠病毒已累计感染全球1.7亿以上人类,

提到病毒,人人色变,

避之唯恐不及,

那为什么又会有“病毒塑造生命”的说法呢?


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美国加州一家水族馆内,潜水员手拿“噬菌体”图片,这是一种感染细菌的病毒,对动植物无害,却对健康的海洋生态系统至关重要。海洋中富集噬菌体和其他病毒,该水族馆1400立方水中,约有病毒数量5320亿,如果它们排成队,能绕地球8圈。

摄影:CRAIG CUTLER


仅从数量上说,病毒可能是地球上多样性最丰富的存在之一。水族馆1400立方米水体就有5320亿个病毒。作家David Quammen追踪科学界关于病毒的最新研究项目,惊奇地发现——


数量庞大的病毒,很可能参与了地球生命形态的各个过程。


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科学家用0.02微米筛子,滤出一份水样并用染色剂标记,大颗粒是细菌,小的则是病毒,再根据筛子尺寸和水的体积,计算每升水的微生物群规模。

摄影:ALEXANDRA RAE SANTORA




撰文:DAVID QUAMMEN


人类是“病毒的孩子”——

我们DNA中有约8%来自远古祖先感染的病毒。


我们活在一个病毒的世界里——其多样性不可捉摸、丰富性难以揣度。仅仅哺乳动物类群就可能携带至少32万种不同病毒,如果再加上非哺乳类动物、植物、陆生细菌和其他可能宿主的病毒,根本数不清。


1983年,前诺奖获得者、生物学家Peter Medawar在其畅销书中说病毒是“包裹在蛋白质里的一条噩耗”,但这种认识是有局限性的,他们对病毒的认识仅限流感、新冠等“凶神恶煞”;但如今我们已知,有些病毒是行善的,包裹在蛋白壳里的是一组基因使者,它们可以带来噩耗,也可能是喜讯。


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一枚稀有的尼安德特人头骨。现代人类走出非洲后,与尼安德特人生育混血后代,并立刻从后者获得多个进化几十万年的基因。科学家们已找到152个遗传自尼安德特人、参与免疫反应的基因,并推断这些基因使我们的祖先能抵御在欧洲遇见的新病毒。

摄影:RÉMI BÉNALI


病毒就像火,作为一种自然现象,既不是全好也不是全坏,既能带来利益也能带来破坏。从宏观层面分析,如果没有病毒,我们甚至从一开始就无法从生命演化的原始混沌中崛起。例如,有两大段源自病毒的DNA,如今嵌在人类和其他灵长类动物的基因组中,而少了这两段序列——就无法怀孕。


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1.5亿年前,感染哺乳动物的病毒留下基因,并导向重大的进化突破:供母体为胎儿输送营养和氧气、排出废物和二氧化碳的胎盘。两个源自病毒的基因——合胞素-1、2参与形成了胎盘膜。

摄影:CRAIG CUTLER


我与病毒学家Thierry Heidmann聊到了一种病毒和一个基因,那个病毒是“HIV”,那个基因是“合胞素-2”(syncytin-2)。


Thierry Heidmann团队筛遍人类基因组的31亿密码字母,寻找到约20个序列与病毒衣壳基因相近的片段,这其中又有两个片段被证实非常重要,一个是之前被科学家发现的合胞素-1;以及Heidmann团队发现的合胞素-2它们能发挥对人类怀孕至关重要的生理功能。


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神经科学家Jason Shepherd托起一张三维重建图片,图中呈现的是一种类似病毒的蛋白壳,它在人的认知和记忆机制中扮演关键角色。编码这个蛋白壳的ARC基因,来自4亿年前一个类病毒祖先。它的形态类似病毒基因组的衣壳,能在人脑和动物脑的神经元间运送传递信息。

摄影:CRAIG CUTLER


病毒对人类怀孕至关重要??


这就要聊到“逆转录病毒”:它们拥有一套运作方向与常规相反的RNA基因组。一般基因是用DNA制造RNA,把RNA作为“信使”交给细胞机器来制造蛋白质;逆转录病毒则用它们的RNA制造DNA,把DNA插入被感染细胞的基因组。举例来说,人免疫缺陷病毒(HIV)就是一种逆转录病毒,会把自己的基因组插入人类免疫细胞的基因组,之后可能进入休眠。在某个时刻,病毒DNA被激活,成为复制大量HIV病毒粒子的模板,最后杀死细胞倾巢而出。


剧情大反转来了!


有些逆转录病毒还会感染生殖细胞——也就是制造精子和卵子的那些细胞,在这一过程中把自己的DNA插入宿主的可遗传基因组。这些插入片段就成为人的“内源性”逆转录病毒(HERV)。


而人类基因组有8%是“内源性”逆转录病毒的DNA,在进化过程中,它们类似一种“插件”——逆转录病毒一点一滴嵌入我们的祖传血统。所以,我们每个人都有1/12的“内源性”逆转录病毒“血统”。在这些“插件”中,能造成深远影响的人类基因之一就是——合胞素-2。


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斯坦福大学发育生物学教授Joanna Wysocka身后,是分裂到八细胞阶段的人类胚胎图片,她和同事们发现,有一个名为HERV-K的“内源性”逆转录病毒会在这个阶段启动,生产蛋白质,并有可能保护胎儿免收病毒感染、参与调控发育。

摄影:CRAIG CUTLER


合胞素-2,一个原本负责帮助病毒融入宿主细胞的基因,辗转嵌入了远古动物的基因组,然后被分配了新职务:去生产类似帮助细胞聚合的蛋白,以形成围绕原始胎盘的特殊结构,从而为一些动物开启了新的可能——体内怀孕。这个革新在进化史上掀起巨潮,使雌性动物得以把后代揣在腹中行动,而不再是把它们留在某处承受凶险,比如巢中的卵。


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名为HERV-K的“内源性”逆转录病毒被染成绿色记录下来

摄影:MARK WOSSIDLO, STANFORD UNIVERSITY/MEDICAL UNIVERSITY OF VIENNA


第一个来自内源性逆转录病毒的此类基因,最终被更能胜任新工作的类似基因替代。斗转星移,胎生的繁殖模式越来越完善,胎盘也在进化。合胞素-2,就是在这个过程中获得的病毒基因;而在人类体内,两种合胞素把细胞聚合起来,在子宫内侧形成了——胎盘层。


胎盘,这个独特的结构在母亲与胎儿间承担交接功能,让营养和氧气流入,运出代谢废物和二氧化碳;可能还保护胎儿不被母亲的免疫系统攻击。从设计效率上来说,它堪称奇迹——进化,把一个病毒部件重塑成了人体部件。


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13周大的胎儿

摄影:LENNART NILSSON, TT/SCIENCE PHOTO LIBRARY (COMPOSITE OF TWO IMAGES)


我们今天只说了一点:我们DNA中约8%来自远古祖先感染的病毒。而我们的身体从病毒那里收编基因,反过来让病毒基因免疫调节、抗癌等方面都有所裨益。关于病毒在触发重大进化转折方面扮演过哪些关键角色,我们现在还知之甚少;直到今天,人类对最简单病毒背后隐藏的复杂机制仍然不甚明了。但如果纳入全部复杂性,去看待哪怕最简单的病毒,也能使人类对自然界千丝万缕的联系有更清晰的认识。




※本文节选自美国《国家地理》中文版《华夏地理》2月刊,
封面图片为“拟菌病毒”——目前已知最大、结构最复杂的病毒之一,科学家们希望通过研究拟菌病毒,为探究病毒本源带来更多启示。


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